Nhà máy có công suất xử lý khoảng 12 tấn chất thải rắn sinh hoạt/ngày, với ba phương án xử lý gồm: thu gom rác thải và phân loại chất thải rắn; công nghệ ủ mùn hữu cơ sinh học thành phân bón giúp cải tạo đất trên đảo; đốt rác thành tro và chôn lấp.
Theo kế hoạch, từ nay đến cuối năm 2015, Cục Quản lý chất thải và cải thiện môi trường sẽ hỗ trợ huyện Lý Sơn trong việc vận hành, sau đó nhà máy sẽ được bàn giao cho địa phương tiếp tục vận hành theo phương án xã hội hóa. Đội thu gom rác của huyện Lý Sơn sẽ tăng cường thu gom, hoạt động nhờ nguồn đóng phí môi trường của người dân và một phần kinh phí từ ngân sách nhà nước.
Theo tính toán, trung bình mỗi ngày trên địa bàn huyện đảo Lý Sơn có hàng chục tấn rác thải sinh hoạt nhưng các hộ dân không biết đổ đi đâu nên đành vứt tứ tung hoặc đổ xuống biển, gây ô nhiễm môi trường nghiêm trọng. Do vậy, việc đưa nhà máy xử lý chất thải rắn sinh hoạt vào hoạt động góp phần làm cho đảo Lý Sơn ngày càng xanh, sạch, đẹp.